Древняя ДНК африканских животных сохраняется до 50 тыс. лет
Ученые показали, что древняя ДНК диких африканских млекопитающих может сохраняться в ископаемых останках гораздо дольше, чем считалось ранее. Новые возможности для изучения исчезнувших животных Южной Африки описывает The Conversation.
За последние 50 тысяч лет с планеты исчезло много крупных млекопитающих. Долгое время исследователи могли судить о них в основном по окаменелостям, однако теперь эту картину дополняет анализ древней ДНК — поврежденного генетического материала, сохранившегося в ископаемых костях и зубах.
Раньше такие работы чаще проводили в холодных северных регионах, где ДНК сохраняется лучше. В жарком климате Африки подобные находки считались редкими, а исследования последних двух тысяч лет в основном касались людей и домашних животных.
Специалисты по африканским копытным и древней ДНК изучили 144 окаменелости с археологических стоянок Южной Африки. Возраст образцов составлял от 1500 до 110 тысяч лет.
Исследование показало, что ДНК может сохраняться до 50 тысяч лет. При этом большинство образцов, в которых удалось найти пригодный генетический материал, были моложе 11 700 лет — границы между плейстоценом и голоценом.
Самая древняя ДНК в выборке принадлежала горному редунку. Останки нашли в пещере Бумплаас в провинции Западный Кейп. По оценке ученых, эта находка может быть самой старой животной ДНК, обнаруженной в Африке, и примерно на 30 тысяч лет превосходить прежние известные образцы.
Авторы работы пришли к выводу, что из останков крупных млекопитающих возрастом в десятки тысяч лет действительно можно извлекать древнюю ДНК. Ранее для африканских условий это считалось почти недостижимым.
Теперь исследователи смогут генетически изучать животных Африки, которые исчезли во время последнего ледникового периода или после него. Кроме того, такие данные помогут проследить, как менялись популяции в голоцене.
Ученые считают, что древняя ДНК может стать ориентиром для оценки прежнего генетического разнообразия диких животных. Это важно для понимания того, какими были популяции до крупных сокращений, связанных с деятельностью человека за последние два столетия.
В работе использовали зубы и кости нескольких видов: капского грисбока, серого ребока, редунка, канны, африканского буйвола и вымершего гигантского длиннорогого буйвола. Образцы происходили из шести пещерных стоянок Восточного и Западного Капа.
Существенных различий в сохранности ДНК между видами исследователи не обнаружили. Однако отдельные стоянки, включая пещеру Нельсон-Бей, сохраняли материал лучше других.
В среднем только около 2% извлеченной ДНК относилось к тому виду, который изучали ученые. Также выяснилось, что сохранность коллагена на части стоянок примерно на 77% совпадала с сохранностью ДНК.
Поэтому коллаген может стать более дешевым ориентиром при выборе образцов для дальнейшего генетического анализа. Это позволит заранее определять, какие кости и зубы с большей вероятностью дадут пригодный материал.
