В Грозном осенью 2001 года произошло событие, которое до сих пор порождает вопросы: сбитый вертолет Ми-8 унес жизни членов комиссии Генерального штаба. Инцидент случился 17 сентября, когда воздушное судно с офицерами на борту было поражено ракетами из переносного зенитного ракетного комплекса. Все находившиеся на борту, включая генерал-майора Анатолия Позднякова и его коллегу Павла Варфоломеева, погибли, а собранные ими документы сгорели.
Следствие установило, что приказ на уничтожение вертолета отдал Шамиль Басаев, выделивший средства на закупку ПЗРК. В 2005 году за этот теракт были осуждены четверо чеченцев, трое из которых получили пожизненные сроки. Однако обстоятельства происшествия вызывают сомнения: по свидетельствам, по вертолету было выпущено две ракеты с разных точек города, что указывает на скоординированность атаки.
Особый интерес вызывает поведение офицеров в момент падения: очевидцы видели, как из вертолета выпадали листы бумаги, которые, вероятно, выбрасывали сами военные, пытаясь спасти важные материалы. Это породило версии о том, что комиссия, занимавшаяся в том числе вопросами сокращения блокпостов, могла обладать данными о коррупции, что делало ее деятельность нежелательной для определенных сил.